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厚朴MVA途径相关基因鉴定及生物信息学分析

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【作者】 查良平袁媛黄璐琦余淑琳

【Author】 ZHA Liang-ping;YUAN Yuan;HUANG Lu-qi;YU Shu-lin;College of Pharmacy,Chengdu University of Traditional Chinese Medicine;State Key Laboratory of Dao-di Herbs,National Resource Center for Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences;

【机构】 成都中医药大学药学院中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地

【摘要】 甲羟戊酸(MVA)途径是萜类化合物生物合成的重要途径,该研究在厚朴转录组测序基础上,利用生物信息学方法对MVA途径中相关基因Mo ACOT,Mo HMGS,Mo HMGR,Mo MK进行全面的生物信息学分析。结果表明,Mo ACOT和Mo MK为稳定的亲水蛋白,而Mo HMGS,Mo HMGR为不稳定的亲水蛋白;二级结构均为混合型结构的蛋白质,α-螺旋是所有基因多肽链中大量的结构元件;利用同源建模法对三级空间结构进行了预测;跨膜域分析显示Mo ACOT,Mo HMGS,Mo MK无跨膜区,MoHMGR具有2个跨膜区,分别为39~61 aa和82~104 aa;系统进化树分析表明Mo ACOT,Mo HMGS,Mo HMGR,Mo MK均与被子植物或双子叶植物遗传距离较近,符合遗传进化规律;基因表达水平显示Mo ACOT,Mo HMGS,Mo HMGR,Mo MK表达水平在厚朴与凹叶厚朴间均无显著差异。研究结果为解析厚朴萜类生物合成MVA途径的分子机制提供理论依据。

【关键词】 厚朴MVA途径萜类转录组生物信息学
【基金】 国家杰出青年科学基金项目(81325023);国家高技术研究发展计划(863)项目(SS2014AA022201)
【所属期刊栏目】 药用植物转录组研究专题 (2015年11期)
  • 【分类号】S567.11
  • 【被引频次】7
  • 【下载频次】386
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