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基于分子对接技术的高频降脂药对作用机制研究

蒋芦荻贺昱甦陈茜陶欧李贡宇张燕玲

北京中医药大学中药信息工程研究室

摘要:中药治疗高脂血症临床疗效确切,但降脂中药的效应物质基础和作用机制仍待进一步明确。该文用关联规则方法分析了2010年版《中国药典》收录的降脂中成药的药对组合规则,并以支持度排序前3的高频药对"葛根-山楂、丹参-山楂、何首乌-山楂"的20个主要化学成分和3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMG-Co A reductase)、过氧化物增殖物激活型受体α(PPAR-α)、Niemann-Pick C1 like 1(NPC1L1)3个关键降脂靶点为研究对象,利用Lib Dock分子对接程序对以上化学成分和靶点的相互作用进行探讨。首先用均方根偏差(RMSD)考察了程序对于3个靶点受体配体结合体系的适用性并得到原配体与受体的对接打分值,再利用已上市药物与对应靶点的相互作用分析获得关键氨基酸,从而建立了基于对接打分值和关键氨基酸作用的降脂活性化合物筛选规则。计算结果表明金丝桃苷、葛根素、丹酚酸A和白藜芦醇苷4个化合物可能同时作用于2个靶点,另外5个成分能够分别作用于一个靶点,揭示高频药对通过作用于多靶点,发挥协同增效的作用。该研究初步阐释了中药降脂高频药对主要化学成分多靶点作用的分子机制,为多靶点降脂新药的研发提供了一定的参考。
  • 专辑:

    医药卫生; 电子技术及信息科学

  • 专题:

    中药学; 计算机软件及计算机应用

  • 分类号:

    TP311.13;R285

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