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罂粟属植物核心DNA条形码的筛选

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【作者】 张爽刘宇婧吴沿胜曹颖袁媛

【Author】 ZHANG Shuang;LIU Yu-jing;WU Yan-sheng;CAO Ying;YUAN Yuan;College of Life and Environmental Sciences,Minzu University of China;School of Agricultural Equipment and Engineering,Jiangsu University;State Key Laboratory of Dao-di Herbs,China Academy of Chinese Medical Sciences;

【机构】 中央民族大学生命与环境科学学院江苏大学农业装备工程学院现代农业装备与技术省部共建教育部重点实验室道地药材国家重点实验室培育基地中国中医科学院中药资源中心

【摘要】 DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种准确、高效且对操作人员要求不高的物种鉴定技术。为了筛选出适合罂粟属的DNA条形码,从GenBank上获得罂粟属植物共69条序列,包括21条ITS序列,10条mat K序列,8条psb A-trnH序列,14条rbcL序列和16条trnL-trnF序列。应用Mega 6.0软件分析了罂粟属的ITS,matK,psbA-trnH,rbcL,trnL-trnF序列的特征,通过计算序列的种内、种间距离,评估序列的Barcoding Gap和构建NJ,UPGMA系统发育树进行分析。分析结果表明:trnL-trn F不仅种内变异和种间变异差别最大,而且有明显的barcoding gap,种内变异和种间变异重合较少,能较好地区分不同种类的罂粟;所构建的NJ和UPGMA系统发育树,也能将全部物种区分开。综合考虑,建议把trnL-trnF作为鉴定罂粟属植物的核心条形码,结合其他片段作为组合条形码。

【关键词】 DNA barcoding罂粟属ITSmatKpsbA-trnHrbcLtrnL-trnF
【基金】 中医药行业专项(201407003)
【所属期刊栏目】 资源与鉴定 (2015年15期)
  • 【分类号】S567.2
  • 【被引频次】7
  • 【下载频次】304
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