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雷公藤CYP450生物信息学及组织分布分析

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【作者】 高杰张逸风周家伟吴晓毅高伟黄璐琦

【Author】 GAO Jie;ZHANG Yi-feng;ZHOU Jia-wei;WU Xiao-yi;GAO Wei;HUANG Lu-qi;School of Traditional Chinese Medicine,Capital Medical University;School of Pharmaceutical Sciences,Capital Medical University;Advanced Innovation Center for Human Brain Protection,Capital Medical University;State Key Laboratory of Dao-di Herbs,National Resource Center for Chinese Materia Medica,Chinese Academy of Chinese Medical Sciences;

【通讯作者】 高伟;黄璐琦;

【机构】 首都医科大学中医药学院首都医科大学药学院首都医科大学人脑保护高精尖创新中心中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地

【摘要】 细胞色素P450家族是一种广泛存在于自然界中的生物催化剂,它具有催化植物次生代谢产物生物合成、调节植物修复等多种功能。该研究基于对雷公藤蛋白组数据的分析,利用多种生物信息学分析的方法对雷公藤CYP450基因进行了初步分析和预测,文章结果显示,使用茉莉酸甲酯诱导雷公藤悬浮细胞表达后,获取到雷公藤蛋白组数据并对其进行分析,最终筛选出10条雷公藤CYP450蛋白;通过分析与拟南芥家族CYP450基因构建得到的系统进化树,将这10条CYP450蛋白聚类归为6个不同的CYP450家族,各个家族CYP450蛋白质的理化性质存在一定差异,二级结构主要以不规则卷曲为主要构成元件,其中8条CYP450蛋白亚细胞定位结果为叶绿体,其余为质体;随后,通过对多重序列比对结果进行分析,找到了CYP450基因共有的保守结构域(亚铁血红素活性位点);最后,通过分析雷公藤转录组数据,初步确认了其在不同组织中的表达分布,从而验证了其与雷公藤活性物质生物合成具有相关性,为雷公藤有效活性成分生物合成途径解析提供了重要的基因资源。

【关键词】 雷公藤CYP450生物信息学
【基金】 国家自然科学基金项目(81773830);北京市自然科学基金项目;北京市教育委员会科技发展计划重点项目(KZ201710025022);北京市属高校长城学者培养计划项目(CIT&TCD20170324toW.G.);“万人计划”青年拔尖人才项目
【所属期刊栏目】 分子生药学 (2019年16期)
  • 【DOI】10.19540/j.cnki.cjcmm.20190603.401
  • 【分类号】S567.19
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】274
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