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日本血吸虫正常发育和发育阻遏雌虫的转录组差异分析

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【作者】 程贵凤李肖纯秦芳林何川川刘金明古少鹏金亚美

【Author】 CHENG Gui-feng;LI Xiao-chun;QIN Fang-lin;HE Chuan-chuan;LIU Jin-ming;GU Shao-peng;JIN Ya-mei;College of Animal Science and Veterinary Medicine,Shanxi Agricultural University;Shanghai Veterinary Research,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Animal Parasitology,Ministry of Agriculture;College of Life Science,Shanghai Normal University;

【通讯作者】 古少鹏;金亚美;

【机构】 山西农业大学动物科技学院中国农业科学院上海兽医研究所农业部动物寄生虫学重点开放实验室上海师范大学生命与环境科学学院

【摘要】 为探讨日本血吸虫雌虫生长发育、性成熟及产卵的调控机制,本研究采用RNA-seq高通量技术对25日龄两性感染而来的正常发育雌虫(MF)和单性感染而来的发育阻遏雌虫(SF)的转录组进行测序、定量及差异基因的筛选。从MF和SF中分别获得3 696 376条和3 662 109条clean reads,将clean reads与日本血吸虫基因组数据库进行匹配发现2组样本的匹配率皆达79%以上。以|Log2 Ratio|≥1, p-Value<0.001为筛选条件,得到775个在MF和SF间差异表达的基因,其中有401个基因在MF中高表达,374个基因在SF中高表达。利用荧光实时定量RT-PCR对差异基因进行验证,结果与RNA-seq相符。生物信息学分析表明,在MF中高表达的基因多与代谢和生物合成过程相关,这些过程对于促进和维持雌性性成熟和产卵至关重要;而在SF中高表达的基因多与运动和细胞通讯等功能相关。这些发现可为深入研究日本血吸虫雌虫生殖发育以及产卵的生物学机理提供一定的理论依据。

【基金】 国家自然科学基金(31672245);上海市自然科学基金(16ZR1444100)
【所属期刊栏目】 实验观察 (2019年06期)
  • 【分类号】S852.7
  • 【下载频次】5
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