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2017-2018年山东省猪流行性腹泻病毒ORF3基因型分析

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【作者】 卢亚平马慧玲张栋陈静李云岗张月

【Author】 LU Ya-ping;MA Hui-ling;ZHANG Dong;CHEN Jing;LI Yun-gang;ZHANG Yue;Shandong Provincial Center for Animal Disease Control and Prevention;

【通讯作者】 李云岗;张月;

【机构】 山东省动物疫病预防与控制中心

【摘要】 为了解山东地区2017-2018年猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行情况,通过RT-PCR方法对山东省各地疑似PEDV病料进行检测,并对阳性样本进行ORF3基因的扩增和遗传进化分析。结果显示,28份具有代表性的PEDV ORF3序列,大小为675 bp,编码224个氨基酸。遗传进化分析显示,28株PEDV ORF3不存在碱基增加或缺失,出现一定规律的碱基突变。28株ORF3基因同源性为94.2%~100%,编码氨基酸同源性为94.7%~99.6%。遗传分析表明,2017-2018年山东省流行的PEDV毒株分为2个亚群,其中22株流行株位于2-1亚群,与韩国病毒株存在一定遗传变异关系,其余6株与南方流行毒株聚类在一起。该试验为持续追踪PEDV的变异趋势和开发PEDV新型疫苗奠定理论基础。

【关键词】 猪流行性腹泻病毒PEDVORF3基因变异
【基金】 山东省自然科学基金(ZR2017BC104)
【所属期刊栏目】 调查研究 (2019年12期)
  • 【分类号】S852.651
  • 【下载频次】6
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