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犬细小病毒临床分离株VP2基因进化分析

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【作者】 温峰琴项海涛郝宝成邢小勇包世俊胡永浩

【Author】 WEN Feng-qin;XIANG Hai-tao;HAO Bao-cheng;XING Xiao-yong;BAO Shi-jun;HU Yong-hao;Veterinary Medicine College , Gansu Agricultural University;Lanzhou Institute of Animal and Veterinary Pharmaceutics Science , Chinese Academy of Agriculture Science;

【通讯作者】 胡永浩;

【机构】 甘肃农业大学动物医学院中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

【摘要】 为了对犬细小病毒临床分离株的VP2基因进行遗传变异分析,了解本地区犬细小病毒流行的优势型别及病毒变异情况。采集2例患犬细小病毒病的动物粪便,提取病毒基因组,设计特异性引物,PCR扩增VP2基因,对扩增产物测序,对序列结果与同属其他毒株VP2基因序列用MEGA 7和MegAlign进行同源性分析和遗传进化分析。同时比较其氨基酸变异情况。结果显示,PCR扩增出VP2基因,测序结果显示大小为1 755 bp,2株病毒VP2基因NCBI序列登录号分别为MH155192和MH155193, MH155192与MF467233.1和JQ743891.1的核苷酸同源性为99.9%,MH155193与KY937651.1、KP260509.1、KY937641.1核苷酸同源性为99.8%。MH155192主要位点氨基酸分别为为267Y,324I,370Q,426D,440A。MH155193主要位点氨基酸分别为267Y,324I,370R,426E,440T。且2株病毒297位均为A。表明分离到的2株病毒分别为新CPV-2b和CPV-2c型。

【关键词】 犬细小病毒VP2基因新CPV-2bCPV-2c序列分析
【基金】 盛彤笙科技创新基金(GSAU-STS-1521);甘肃农业大学动物医学院教研产学支持计划(JYCX-KX014)
【所属期刊栏目】 实验观察 (2019年12期)
  • 【分类号】S852.655
  • 【下载频次】4
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