记笔记

一株野鸟源H1N1亚型禽流感病毒的遗传进化特征及其系统学分析

摘要：从2007年秋季在黑龙江省三江国家级自然保护区采集的绿头鸭（Anas platyrhynchos）泄殖腔样品中,分离到一株A型禽流感病毒,亚型鉴定结果为H1N1,命名A/Mallard/Sanjiang/390/2007（H1N1）,简称为MD/San-jiang/390/2007（H1N1）。对8个基因片段（PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M、NS）进行了扩增与序列测定,其中HA基因序列的氨基酸裂解位点序列为PSIQSR↓GLFGAI,符合低致病性禽流感病毒（LPAIV）的序列特征。从该病毒基因组的系统进化分析看出:除PA基因属于北美群系禽流感病毒外,其余基因均属于欧亚群系禽流感病毒;与猪流感病毒、季节性人流感病毒、2009年新型H1N1流感病毒的比较来看,亲缘性较远,均处于不同分支,HA亚型分类属于h1.1.2。NP基因与家鸭分离株A/duck/Hokkaido/Vac-3/2007（H5N1）的核苷酸同源性为99.4%,M基因与家鸭分离株A/duck/Hokkaido/W90/2007（H10N7）的核苷酸同源性达99.6%,PB1基因与NP基因和猪分离株A/swine/Korea/C12/2008（H5N2）的核苷酸同源性分别达99.2%、99.1%,提示该病株可能是一个整合了来源于家鸭和猪的多个亚型AIV基因片段的重组病毒。

关键词：

野生源H1N1禽流感病毒; 系统进化分析; 基因重组;

基金资助：

野生鸟类禽流感病毒生态分布研究及病毒库建立（SKLVBF200906）；东北林业大学研究生科技创新项目；中央高校基本科研业务费专项资金项目（DL09BA01）；