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化学因素对基于DNA折纸界面上的核酸适配体与凝血酶相互作用影响的研究

樊友杰1吴娜2,3李宾2

1. 宁波大学物理系2. 中国科学院上海应用物理研究所,物理生物学研究室3. 中国科学院大学

摘要:核酸适配体(aptamer)与DNA折纸都是由DNA分子折叠而成,两者具有得天独厚的相似性与相容性。本文将aptamer修饰在DNA折纸界面预先设定的位置上,通过原子力显微镜成像手段,在单分子水平上研究了化学因素对DNA折纸界面上的aptamer与凝血酶(thrombin)反应的影响。实验结果表明:修饰固定在DNA折纸界面上的aptamer与thrombin间的结合能力与缓冲液、某些金属离子及其浓度相关,发现HEPES缓冲液是一种比较适合基于DNA折纸的aptamer与thrombin反应的化学反应环境,在此缓冲体系中加入一定浓度的Mg2+和K+是保持反应体系稳定性及其DNA空间构型的有效途径。该研究结果有助于加深对aptamer的三维结构以及与靶分子间的对应识别关系的理解,对DNA折纸与aptamer在生物分子识别的研究和应用方面将起到一定的借鉴作用。
  • 专辑:

    电子技术及信息科学; 理工A(数学物理力学天地生)

  • 专题:

    生物学

  • 分类号:

    Q52

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