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游离二氧化硅所致肺成纤维细胞转分化过程中DNA甲基化差异基因的MeDIP-seq检测

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【作者】 侯建永姚武郝长付

【Author】 HOU Jianyong;YAO Wu;HAO Changfu;Department of Occupational Health,College of Public Health,Zhengzhou University;

【机构】 郑州大学公共卫生学院劳动卫生学教研室

【摘要】 目的:检测游离二氧化硅所致肺成纤维细胞转分化过程中可能存在的DNA甲基化差异基因并探讨其可能作用机制。方法:原代培养肺成纤维细胞和肺泡巨噬细胞,建立共培养的矽肺体外模型,采用甲基化DNA免疫共沉淀测序技术检测分析不同染毒时间(0、24、48 h)的肺成纤维细胞之间的DNA甲基化差异基因,并采用DAVID工具对检测到的甲基化差异基因进行KEGG的通路富集分析。结果:共发现8 791个基因的DNA甲基化程度在3个染毒时间组中均存在差异,DAVID工具分析发现这些差异主要集中在代谢、环境信息过程、细胞过程、生物体系统、人类疾病相关通路等通路中。结论:矽肺形成过程中存在大量DNA甲基化程度发生改变的基因,且这些基因涉及多个通路。

【基金】 国家自然科学基金资助项目81102109;81472954
【所属期刊栏目】 论著 (2017年01期)
  • 【DOI】10.13705/j.issn.1671-6825.2017.01.002
  • 【分类号】R135.2
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】378
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