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贲门癌中长链非编码RNA和微小RNA差异表达谱及相关性分析

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【作者】 杨俊强胡晓辰齐义军高社干

【Author】 YANG Junqiang;HU Xiaochen;QI Yijun;GAO Shegan;College of Clinical Medicine,Medical College,Henan University of Science and Technology, Cancer Hospital,the First Affiliated Hospital of Henan University of Science and Technology, Henan Key Laboratory of Cancer Epigenetics;

【机构】 河南科技大学医学院临床医学院河南科技大学第一附属医院肿瘤医院河南省肿瘤表观遗传重点实验室

【摘要】 目的:分析贲门癌与癌旁组织中长链非编码RNA(lncRNA)和微小RNA(miRNA)的差异表达谱及二者的相关性。方法:利用基因芯片技术鉴定15例贲门癌与癌旁组织中的lncRNA及miRNA的差异表达谱,生物信息方法分析与H19相互作用的候选miRNA分子,qRT-PCR验证H19和miR-148a-3p在贲门癌中表达的相关性。结果:15例贲门癌与癌旁组织中鉴定出5倍以上差异性表达的lncRNA 182个,2倍以上差异性表达的miRNA 152个。生物信息学预测结果表明,lncRNA H19与7个miRNA表达具有相关性。qRT-PCR验证37例贲门癌与癌旁组织中H19和miR-148a-3p的表达呈负相关(r=-0.398,P<0.001)。结论:贲门癌中差异表达的lncRNA和miRNA分子参与了癌变过程,H19可能直接调控miR-148a-3p的表达。

【基金】 国家自然科学基金资助项目(81472234)
【所属期刊栏目】 食管癌研究 (2018年01期)
  • 【DOI】10.13705/j.issn.1671-6825.2017.03.043
  • 【分类号】R735.2
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】556
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