孕妇血浆中胎儿游离DNA浓度检测新方法

【作者】 刘弘泰； 陈大洋； 康雄斌； 殷旭阳； 高雅； 王威；

【Author】 LIU Hongtai;CHEN Dayang;KANG Xiongbin;YIN Xuyang;GAO Ya;WANG Wei;BGI Education Center,University of Chinese Academy of Sciences;Key Laboratory of Human Genome Disease,BGI Diagnosis Co.,Ltd;

【机构】 中国科学院大学华大教育中心； 深圳华大基因临床检测中心/人类疾病基因组学企业重点实验室；

【摘要】 目的:准确检测胎儿游离DNA占孕妇血浆中总游离DNA的比例,即胎儿游离DNA浓度。方法:收集孕有正常男胎的孕妇血浆30例,孕有正常女胎的孕妇血浆2例,其中10例与对照组孕周相同的正常男胎样本作为实验组。对照组为5例孕有21三体(T21)男胎的孕妇血浆。分别提取孕妇血浆中的游离DNA,应用多重PCR结合高通量测序技术检测胎儿特异性的单核苷酸多态性位点(SNP),以此作为胎儿DNA标记物,以计算孕妇血浆中胎儿游离DNA的浓度。此外,采用基于Y染色体(ChrY)特异基因及目标区域捕获测序的方法计算相同样本的胎儿游离DNA浓度。结果:(1)新方法检测的胎儿游离DNA浓度结果与ChrY及目标区域捕获测序计算的结果一致,无显著差异(P>0.05),且具有较高的一致性(R2=0.982)。(2)孕有21三体男胎组中胎儿游离DNA浓度(17.3%±4.7%)明显高于相同孕周的孕有正常男胎组(11.8%±3.4%),两组胎儿游离DNA浓度存在差异(P<0.05)。结论:多重PCR结合高通量测序技术能够准确计算孕妇血浆中的胎儿游离DNA浓度,具备较强的临床应用价值。更多还原