濒危兰科药用植物DNA条形码鉴定

汤欢向丽李西文孙伟王美娜黄云峰叶萌

四川农业大学林学院中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性检测评估北京市重点实验室全国兰科植物种质资源保护中心深圳市兰科植物保护研究中心广西中医药研究院

摘要：兰科药用植物形态分类困难,此研究采用DNA条形码分子鉴定法从分子水平验证兰科药用植物的传统形态分类。以matK,psbA-trnH和ITS2序列作为DNA条形码对已进行了形态鉴定的49属135种163份兰科药用植物样品进行分子鉴定,经DNA提取,PCR扩增、双向测序及校对拼接后,将得到的序列在GenBank中进行BLAST比对,然后运用MEGA 7.0软件中的Neighbor-joining（NJ）法构建物种系统进化树。结果表明,163份样品均能成功提取DNA;matK,psbA-trnH和ITS2序列的PCR扩增效率分别为100%,100%,98.77%;共获得487条序列,其中345条序列在GenBank数据库中比对到了相应物种的序列,142条为新增序列;运用NJ法构建的兰科药用植物系统进化树中,基于matK序列所构建的物种系统进化树要优于基于psbA-trnH和ITS2序列所构建的系统进化树。matK,psbA-trnH和ITS2序列在鉴定兰科药用植物过程中互为补充,DNA条形码分子鉴定法可用于辅助兰科药用植物的分类鉴定。

关键词：

兰科; DNA条形码; 药用植物; 分子鉴定;

基金资助：

四川省科技计划项目（2013SZ0117）；